Учреждена в 2005 году ИД «Вокруг света» и редакцией журнала «Полдень, XXI век». Первое вручение состоялось 6 мая 2006 г.

«Полдень, XXI век» — литературно-художественный журнал, посвященный отечественной фантастике, выходивший в Санкт-Петербурге с 2002 по 2013 гг. под редакцией Бориса Стругацкого.

26 мая 2005 года на «Невском книжном форуме» Борис Стругацкий объявил об учреждении ежегодной литературной премии журнала, но только через год — 6 мая 2006 года премия «Полдень» была вручена впервые.

Литературная премия «Полдень» учреждена в целях стимулирования творческой активности авторов, работающих в малой и средней формах всех направлений фантастики, продолжающей лучшие традиции отечественной литературы.

Литературная премия «Полдень» присуждается за лучшее произведение, опубликованное в альманаха «Полдень» в минувшем году. Награждается не автор, а произведение. Поэтому один и тот же писатель может становиться лауреатом премии неоднократно.

Премия вручается по 3 номинациям:

а) средняя форма (журнальный вариант романа, повесть);

б) малая форма (рассказ, микрорассказ, миниатюра);

в) критика и публицистика (статья, очерк, эссе).

Лауреаты получают памятный «Диплом лауреата премии „Полдень“».

Возрождена редакцией альманаха «Полдень» в 2016 году (по итогам публикаций в электронном альманахе в течение 2015 года).

Долгое время вручалась на конвенте «Интерпресскон», сейчас вручается на различных культурных мероприятиях.

C 2006 по 2012 год премия вручалась за публикации в журнале «Полдень, XXI век. C 2016 года премия вручается за публикации в альманахе «Полдень».

До 2017 года премия вручалась по двум номинациям. C 2017 года премия вручается по трем номинациям.

В 2024 году премия вручалась по итогам двух лет, 2022 и 2023.